Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 4

Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
 
Author:
George M. Garrity, Don J. Brenner,
Noel R. Krieg & James T. Staley
Publisher:
Springer
ISBN No: 978-0387-9-5042-6
Release at: 2010
Pages: 976
Edition:
Second Edition/Volume 4 The
Bacteroidetes, Spirochaetes, 
Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria,
Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi,
Gemmatimonadetes, Lentisphaerae,
Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes
File Size: 16 MB
File Type: pdf
Language: English



Description of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2nd Edition Volume 4


Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 4 (pdf) Free Download. Written by James T. Staley, David R. Boone, Don J. Brenner, and et al. The Editors is a long-standing tradition of Bergey’s Manual to open their respective editions with the observation that the new edition is a departure from the earlier ones. As this volume goes to press, however, we recognize a need to deviate from this practice, by offering a separate preface to each volume within Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2nd edition. In part, this departure is necessary because the size and complexity of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology edition far exceeded our expectations, as has the amount of time that has elapsed between the publication of the first volume of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2nd edition and Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 4.

Systematic procaryotic biology is a dynamic field, driven by methodological advances and constant theoretical that will ultimately lead to a more useful and perfect classification scheme. Much of the increase can be attributed to rapid advances in sequencing technology, which has brought about a major shift in how we view the relationships between Bacteria and Archaea. While universally possibility for the applicable natural classification was evident as the First Edition was in preparation, it is only recently that the sequence databases became the taxonomic coverage and large enough broad enough to make such an arrangement feasible.

Content of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2nd Edition Volume 4



Phylum XIV. Bacteroidetes Phyl. nov.  25

Class I.  Bacteroidia class.  nov.   25

Order I.  Bacteroidales ord.  nov.   25

Family I.  Bacteroidaceae  25

Genus I.  Bacteroides.   27

Genus II.  Acetofilamentum  41

Genus III.  Acetomicrobium  42

Genus IV.  Acetothermus44

Genus V. Anaerorhabdus  45

Family II.  Marinilabiliaceae fam.  nov.   49

Genus I.  Marinilabilia.   49

Genus II.  Anaerophaga51

Genus III.  Alkaliflexus.   53

Family III.  Rikenellaceae fam.  nov  54

Genus I.  Rikenella  55

Genus II.  Alistipes.  56

Family IV.  Porphyromonadaceae fam.  nov61

Genus I.  Porphyromonas.   62

Genus II. Barnesiella.   70

Genus III.  Dysgonomonas  71

Genus IV.  Paludibacter  76

Genus V.  Petrimonas.   77

Genus VI.  Proteiniphilum.   77

Genus VII.  Tannerella.   78

Family V.  Prevotellaceae fam.  nov  85

Genus I.  Prevotella  86

Genus II.  Xylanibacter  102

Class II.  Flavobacteriia class.  nov.   105

Order I.  Flavobacteriales ord.  nov105

Family I.  Flavobacteriaceae.   106

Genus I.  Flavobacterium.   112

Genus II.  Aequorivita.   155

Genus III.  Algibacter157

Genus IV.  Aquimarina.   158


Genus V.  Arenibacter.   161

Genus VI.  Bergeyella.   165

Genus VII.  Bizionia  166

Genus VIII.  Capnocytophaga.   168

Genus IX.  Cellulophaga176

Genus X.  Chryseobacterium.   180

Genus XI.  Cloacibacterium  197

Genus XII.  Coenonia.   198

Genus XIII.  Costertonia199

Genus XIV.  Croceibacter.   199

Genus XV.  Dokdonia.   201

Genus XVI.  Donghaeana.   201

Genus XVII.  Elizabethkingia202

Genus XVIII.  Empedobacter210

Genus XIX.  Epilithonimonas212

Genus XX.  Flaviramulus213

Genus XXI.  Formosa.   214

Genus XXII.  Gaetbulibacter218

Genus XXIII.  Gelidibacter.   219

Genus XXIV.  Gillisia221

Genus XXV.  Gramella.   226

Genus XXVI.  Kaistella  227

Genus XXVII.  Kordia.   228

Genus XXVIII.  Krokinobacter.   230

Genus XXIX.  Lacinutrix231

Genus XXX.  Leeuwenhoekiella232

Genus XXXI.  Lutibacter234

Genus XXXII.  Maribacter.   235

Genus XXXIII.  Mariniflexile  238

Genus XXXIV.  Mesonia239

Genus XXXV.  Muricauda.   240

Genus XXXVI.  Myroides245

Genus XXXVII.  Nonlabens  248

Genus XXXVIII.  Olleya  249

Genus XXXIX.  Ornithobacterium.   250

Genus XL.  Persicivirga  254

Genus XLI.  Polaribacter255

Genus XLII.  Psychroflexus258

Genus XLIII.  Psychroserpens.   261

Genus XLIV.  Riemerella262

Genus XLV.  Robiginitalea.   264

Genus XLVI.  Salegentibacter.   266

Genus XLVII.  Sandarakinotalea269

Genus XLVIII.  Sediminicola270

Genus XLIX.  Sejongia  271

Genus L.  Stenothermobacter.   275

Genus LI.  Subsaxibacter.   275

Genus LII.  Subsaximicrobium.   277

Genus LIII.  Tenacibaculum  279

Genus LIV.  Ulvibacter.   283

Genus LV.  Vitellibacter  284

Genus LVI.  Wautersiella285

Genus LVII.  Weeksella286

Genus LVIII.  Winogradskyella.   288

Genus LIX.  Yeosuana.   291

Genus LX.  Zhouia.   292

Genus LXI.  Zobellia292

Family II.  Blattabacteriaceae fam.  nov  315

Genus I.  Blattabacterium.   315

Family III.  Cryomorphaceae.   322

Genus I.  Cryomorpha.   323

Genus II.  Brumimicrobium  323

Genus III.  Crocinitomix  326

Genus IV.  Fluviicola327

Genus V.  Lishizhenia.   327

Genus VI.  Owenweeksia.   328

Class III.  Sphingobacteriia class.  nov.   330

Order I.  Sphingobacteriales ord.  nov  330

Family I.  Sphingobacteriaceae331

Genus I.  Sphingobacterium331

Genus II.  Pedobacter.   339

Family II.  Chitinophagaceae fam.  nov  351

Genus I.  Chitinophaga  351

Genus II.  Terrimonas.   356

Family III.  Saprospiraceae fam.  nov.   358

Genus I.  Saprospira359

Genus II.  Aureispira361

Genus III.  Haliscomenobacter  363

Genus IV.  Lewinella366

Class IV.  Cytophagia class.  nov  370

Order I.  Cytophagales370

Family I.  Cytophagaceae  371

Genus I.  Cytophaga371

Genus II.  Adhaeribacter375

Genus III.  Arcicella  377

Genus IV.  Dyadobacter  380

Genus V.  Effluviibacter  387

Genus VI.  Emticicia388

Genus VII.  Flectobacillus.   389

Genus VIII.  Flexibacter  392

Genus IX.  Hymenobacter  397

Genus X.  Larkinella404

Genus XI.  Leadbetterella.   405

Genus XII.  Meniscus.   406

Genus XIII.  Microscilla  408

Genus XIV.  Pontibacter  410

Genus XV.  Runella  412

Genus XVI.  Spirosoma  415

Genus XVII.  Sporocytophaga.   418

Family II.  Cyclobacteriaceae fam.  nov  423

Genus I.  Cyclobacterium.   423

Genus II.  Algoriphagus  426

Genus III.  Aquiflexum.   433

Genus IV.  Belliella.   434

Genus V.  Echinicola437

Genus VI.  Rhodonellum440

Family III.  Flammeovirgaceae fam.  nov442

Genus I.  Flammeovirga442

Genus II.  Fabibacter447

Genus III.  Flexithrix  448

Genus IV.  Persicobacter450

Genus V.  Reichenbachiella  452

Genus VI.  Roseivirga.   453

Order II.  Incertae sedis.   457

Family I.  Rhodothermaceae fam.  nov  457

Genus I.  Rhodothermus.   458

Genus II.  Salinibacter.   460

Order III.  Incertae sedis  465

Genus I.  Thermonema  465

Order IV.  Incertae sedis  467

Genus I.  Toxothrix  467

Phylum XV.  Spirochaetes phyl.  nov471

Class I.  Spirochaetia class.  nov  471

Order I.  Spirochaetales.   471

Family I.  Spirochaetaceae473

Genus I.  Spirochaeta.   473

Genus II.  Borrelia.   484

Genus III.  Cristispira498

Genus IV.  Treponema.   501

Family II.  Brachyspiraceae531

Genus I.  Brachyspira.   531

Family III.  Brevinemataceae fam.  nov  545

Genus I.  Brevinema545

Family IV.  Leptospiraceae  546

Genus I.  Leptospira546

Genus II.  Leptonema.   556

Genus III.  Turneriella.   558

Hindgut spirochetes of termites and Cryptocercus punctulatus.   563

Phylum XVI.  Tenericutes.   567

Class I.  Mollicutes.   568

Order I.  Mycoplasmatales574

Family I.  Mycoplasmataceae  575

Genus I.  Mycoplasma.   575

Genus II.  Ureaplasma.   613

Family II.  Incertae sedis.   639

Genus I.  Eperythrozoon640

Genus II.  Haemobartonella642

Order II.  Entomoplasmatales644

Family I.  Entomoplasmataceae.   645

Genus I.  Entomoplasma646

Genus II.  Mesoplasma  649

Family II.  Spiroplasmataceae  654

Genus I.  Spiroplasma.   654

Order III.  Acholeplasmatales  687

Family I.  Acholeplasmataceae687

Genus I.  Acholeplasma688

Family II.  Incertae sedis.   696

Genus I.  “Candidatus Phytoplasma” gen.  nov.   696

Order IV.  Anaeroplasmatales719

Family I.  Anaeroplasmataceae720

Genus I.  Anaeroplasma720

Genus II.  Asteroleplasma.   722

Phylum XVII.  Acidobacteria phyl.  nov.   725

Class I.  Acidobacteriia.   727

Order I.  Acidobacteriales727

Family I.  Acidobacteriaceae fam.  nov  728

Genus I.  Acidobacterium.   728

Genus II.  Edaphobacter729

Genus III. Terriglobus.   730

Class II.  Holophagae731

Order I.  Holophagales731

Family I.  Holophagaceae  732

Genus I.  Holophaga732

Genus II.  Geothrix  732

Order II.  Acanthopleuribacterales734

Family I.  Acanthopleuribacteraceae.   734

Genus I.  Acanthopleuribacter.   734

Phylum XVIII.  “Fibrobacteres”  737

Class I.  Fibrobacteria class.  nov739

Order I.  Fibrobacterales ord.  nov  739

Family I.  Fibrobacteraceae fam.  nov.   739

Genus I.  Fibrobacter740

Phylum XIX.  “Fusobacteria”747

Class I.  Fusobacteriia class.  nov747

Order I.  Fusobacteriales ord.  nov747

Family I.  Fusobacteriaceae fam.  nov.   748

Genus I.  Fusobacterium748

Genus II.  Cetobacterium.   758

Genus III.  Ilyobacter759

Genus IV.  Propionigenium  761

Family II.  Leptotrichiaceae fam.  nov.   766

Genus I.  Leptotrichia.   766

Genus II.  Sebaldella769

Genus III.  Sneathia  770

Genus IV.  Streptobacillus.   771

Phylum XX.  Dictyoglomi phyl.  nov  775

Class I.  Dictyoglomia class.  nov  776

Order I.  Dictyoglomales ord.  nov  776

Family I.  Dictyoglomaceae fam.  nov.   776

Genus I.  Dictyoglomus  776

Phylum XXI.  Gemmatimonadetes  781

Class I.  Gemmatimonadetes781

Order I.  Gemmatimonadales  781

Family I.  Gemmatimonadaceae.   782

Genus I.  Gemmatimonas.   782

Phylum XXII.  Lentisphaerae.   785

Class I.  Lentisphaeria class.  nov787

Order I.  Lentisphaerales  788

Family I.  Lentisphaeraceae fam.  nov.   788

Genus I.  Lentisphaera  788

Order II.  Victivallales  791

Family I.  Victivallaceae fam.  nov791

Genus I.  Victivallis  791

Phylum XXIII.  Verrucomicrobia phyl.  nov.   795

Class I.  Verrucomicrobiae.   799

Order I.  Verrucomicrobiales  802

Family I.  Verrucomicrobiaceae 803

Genus I.  Verrucomicrobium 803

Genus II.  Prosthecobacter  805

Family II.  Akkermansiaceae fam.  nov  809

Genus I.  Akkermansia  809

Family III.  Rubritaleaceae fam.  nov 812

Genus I.  Rubritalea812

Class II.  Opitutae817

Order I.  Opitutales820

Family I.  Opitutaceae  820

Genus I.  Opitutus.   820

Genus II.  Alterococcus  821

Order II.  Puniceicoccales 823

Family I.  Puniceicoccaceae.   824

Genus I.  Puniceicoccus 824

Genus II.  Cerasicoccus 825

Genus III.  Coraliomargarita 827

Genus IV.  Pelagicoccus 829

Class III.  Spartobacteria class.  nov 834

Order I.  Chthoniobacterales ord.  nov  836

Family I.  Chthoniobacteraceae fam.  nov.   837

Genus I.  Chthoniobacter.   837

Genus II.  “Candidatus Xiphinematobacter”  838

Phylum XXIV.  “Chlamydiae” 843

Class I.  Chlamydiia class.  nov.   844

Order I.  Chlamydiales844

Family I.  Chlamydiaceae.   845

Genus I.  Chlamydia 846

Family II.  “Candidatus Clavichlamydiaceae”.   865

Genus I.  “Candidatus Clavichlamydia”  865

Family III.  Criblamydiaceae 867

Genus I.  Criblamydia.   867

Family IV. Parachlamydiaceae 867

Genus I.  Parachlamydia 868

Genus II. Neochlamydia.   869

Genus III.  Protochlamydia gen.  nov 870

Family V.  “Candidatus Piscichlamydiaceae”.   872

Genus I.  “Candidatus Piscichlamydia”  872

Family VI.  Rhabdochlamydiaceae fam.  nov 873

Genus I.  Rhabdochlamydia gen.  nov.   873

Family VII. Simkaniaceae  874

Genus I.  Simkania .   875

Genus II.  “Candidatus Fritschea”.   875

Family VIII.  Waddliaceae.   876

Genus I.  Waddlia.   877

Phylum XXV.  “Planctomycetes” 879

Class I.  Planctomycetia class.  nov.   879

Order I.  Planctomycetales879

Family I.  Planctomycetaceae.   880

Genus I.  Planctomyces  881

Genus II.  Blastopirellula895

Genus III.  Gemmata897

Genus IV.  Isosphaera  900

Genus V.  Pirellula.   903

Genus VI.  Rhodopirellula.   906

Genus VII.  Schlesneria  910

Genus VIII.  Singulisphaera  913

Order II.  “Candidatus Brocadiales” ord.  nov.   918

Family I.  “Candidatus Brocadiaceae” fam.  nov 918

See Also




Similar Books

0 comments: